98版五笔输入法是在86版五笔输入法的基础上改进而成的，86版五笔和98版五笔区别较大。发明了86版以后，王永民用10年时间才把98版整理出来，传说五笔98版比五笔86版好，但如果你学了86五笔，就没有必要再改学98。98比86更科学，在学习上也更容易，但它的普及程度远不如86。目前全网只有少数用户使用98五笔，且大部分五笔软件都是以86为编码标准的。
98版五笔字根表口诀
11G 王旁青头五夫一，
12F 土干十寸未甘雨，
13D 大犬戊其古石厂，
14S 木丁西甫一四里，
15A 工戈草头右框七。
21H 目上卜止虎头具，
22J 日早两竖与虫依，
23K 口中两川三个竖，
24L 田甲方框四车里，
25M 山由贝骨下框集。
31T 禾竹反文双人立，
32R 白斤气丘叉手提，
33E 月用力豸毛衣臼，
34W 人八登头单人几，
35Q 金夕鸟儿犭边鱼。
41Y 言文方点谁人去，
42U 立辛六羊病门里，
43I 水族三点鳖头小，
44O 火业广鹿四点米，
45P 之字宝盖补礻衤。
51N 已类左框心尸羽，
52B 子耳了也乃框皮，
53V 女刀九艮山西倒，
54C 又巴牛厶马失蹄，
55X 幺母贯头弓和匕。
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